近年來在感染領(lǐng)域備受關(guān)注的宏基因組技術(shù)是否徹底改變了該領(lǐng)域？復(fù)旦大學(xué)附屬華山醫(yī)院感染科主任張文宏認(rèn)為，改變或者未改變事實(shí)上需要一次考驗(yàn)，“當(dāng)考驗(yàn)來了以后，我們就知道是不是改變，我認(rèn)為至少在這次新冠來臨中改變了。”

8月22日下午，在上海舉行的華大基因感染分子診斷高峰論壇上，張文宏分享了宏基因組檢測技術(shù)在整個(gè)大感染科中的應(yīng)用。基于宏基因組學(xué)測序（mNGS）的病原學(xué)診斷技術(shù)是一種非靶向的廣譜病原學(xué)篩查技術(shù)，其不依賴于傳統(tǒng)的微生物培養(yǎng)，直接對臨床樣本中的核酸進(jìn)行高通量測序，能夠快速、客觀地檢測臨床樣本中的較多病原微生物，包括病毒、細(xì)菌、真菌、寄生蟲。

張文宏在現(xiàn)場以此次新冠疫情為例，宏基因組測序利用其技術(shù)優(yōu)勢，數(shù)天內(nèi)快速鑒定并分析出新冠病毒的基因組，中國團(tuán)隊(duì)也在1月11日率先向全球公布了新冠病毒基因組序列。與之對比的是，2003年SARS的鑒定耗時(shí)5個(gè)多月、2013年H7N9的鑒定也耗時(shí)1個(gè)多月。“有誰說這個(gè)時(shí)間還不夠快，應(yīng)該更快一點(diǎn)，我倒是要問在世界上任何一次對新發(fā)傳染病的識別有沒有比這次更快的？事實(shí)上沒有。”

張文宏表示，“相信這一次從疾病的預(yù)警到確認(rèn)都跟二代測序的應(yīng)用有關(guān)，所以新技術(shù)的應(yīng)用和誕生對整個(gè)領(lǐng)域的進(jìn)展是非常重要的一件事情。”

張文宏團(tuán)隊(duì)在現(xiàn)場也提到其團(tuán)隊(duì)用宏基因組技術(shù)確診不明原因感染性疾病方面的多個(gè)案例。其中提到一名曾經(jīng)到過非洲的患者感染了非洲錐蟲病，該患者在長達(dá)6個(gè)月的時(shí)間里未得到確診，耗費(fèi)近百萬。“來的時(shí)候奄奄一息，當(dāng)時(shí)第一個(gè)技術(shù)啟動了抗體檢測，第二個(gè)技術(shù)啟動了二代測序檢測，在48小時(shí)的時(shí)候拿到測序數(shù)據(jù)，最終在72小時(shí)內(nèi)我們從日內(nèi)瓦找到藥，最終病人治愈。”

張文宏認(rèn)為，這再次證明宏基因組技術(shù)診斷寄生蟲疾病也是非常好的。“這樣一個(gè)病例就成為在世界上第一例非洲錐蟲病可以用基因組學(xué)診斷的病例，所以我認(rèn)為我們要解決臨床的問題，這是醫(yī)生和臨床微生物學(xué)要做到的非常重要的問題。”

張文宏在現(xiàn)場提及，“盡一切能力找到病源學(xué)的依據(jù)，這個(gè)應(yīng)該成為我們感染科將來新一代發(fā)展的主要方向。”

不過他同時(shí)提醒，宏基因組技術(shù)并不是一個(gè)唯一的解。“事實(shí)上我要提醒大家，NGS的功能強(qiáng)大，但是不能所有的感染性疾病都要第一時(shí)間拿過來用，除非它是白菜價(jià)，如果人家不是白菜價(jià)，我建議大家要節(jié)約病人的醫(yī)療資源。”

張文宏表示，傳統(tǒng)的臨床微生物是根本，堅(jiān)決不能丟掉，需在這個(gè)基礎(chǔ)上再去考慮其他的分子診斷等方法，“應(yīng)該是一個(gè)多種辦法的聯(lián)合診斷，我們最懼怕的是人家給你介紹一樣?xùn)|西，我們就都盯著這個(gè)東西，把最根本的最原始的東西給放棄掉了。”

他在最后總結(jié)道，“從新冠開始，我們進(jìn)入一個(gè)新的時(shí)代，這個(gè)時(shí)代就是一個(gè)精準(zhǔn)治療的時(shí)代，中國今天的新冠防治也是一個(gè)精準(zhǔn)防治，所以在未來的感染科，我相信在臨床微生物基礎(chǔ)上的精準(zhǔn)治療將是我們未來發(fā)展的方向。”