原創 王宇歌 博士 Hanson臨床科研

關鍵詞：新型冠狀病毒；起源；解讀

新型冠狀病毒（SARS-CoV-2）的起源和傳播一直是人們最關心的問題。

復旦大學張永振等在Cell上發表了Commentary，概述了新冠病毒的病毒基因組研究起源，這與Andersen剛剛發表的Nature Med文章互補，為病毒傳播繪制了一個比較完整的藍圖。

我們的專欄科學家王宇歌博士第一時間解讀了這項研究。

作者從趨同進化-跨種傳播-隱匿傳播等作出了解釋。

趨同進化

目前公認因為無癥狀傳播和發病前傳播的特性使SARS-CoV-2的傳染性極強。

由于華南海鮮市場的動物樣本已無法取樣，現在也無法獲知最早的COVID-19感染者（0號病人），因此無法明確SARS-CoV-2最終形成是由于動物跨種直接傳播引起，還是隱性人傳人引起。

目前報道的第一例COVID-19患者是2019年12月26日在武漢中心醫院收治入院的病人。張永振等1月5日獲得了該病人的病毒基因組序列，并將序列上傳到了GenBank（MN908947），并于1月11日上傳到了Virological。

截止目前已經有超過200個SARS-CoV-2的基因組序列。由于病毒序列信息，研究人員進一步將其序列與其他病毒比對，發現這一病毒屬于SARS-CoV家族，與SARS-CoV本身有79%同源性。因此SARS-CoV-2被歸入beta冠狀病毒。

而與SARS-CoV-2相似度最高的病毒是在云南發現的RaTG13，序列同源性高達96%。但SARS-CoV-2與RaTG13序列最顯著的差異是S蛋白的S1和S2亞基交界處的多堿基Furin蛋白酶切割位點（殘基PRRA），這一切PRRA還見于冠狀病毒HCoV-HKU1；SARS-CoV-2與RaTG13序列另一個不同是在RBD結合ACE2的6個關鍵氨基酸中，只有1個相同。

而本綜述中，作者又提出了另一個重要信息，在S1/S2切割位點有另一個十分特殊的PAA氨基酸序列，這一PAA序列見于2019年從云南的蝙蝠樣品中發現的另一株冠狀病毒RmYN02，但RmYN02僅與SARS-CoV-2有72%序列同源性。

跨種傳播

SARS-CoV-2起源于蝙蝠目前有大量證據支持，但是從蝙蝠到人的傳播鏈還不清晰。

比如RaTG13和RmYN02都在云南發現，距離武漢有1500公里，而從RaTG13進化到SARS-CoV-2需要25-65年。這使得科學家猜想中間宿主所扮演的角色。SARS-CoV和MERS-CoV從蝙蝠到人，分別由果子貍和駱駝充當了中間宿主；而華南農業大學論文證明了穿山甲冠狀病毒的RBD與SARS-CoV-2具有97%氨基酸序列同源性，這一發現完善了SARS-CoV-2跨種傳播鏈的假說，但它也啟發科學家可能在野生哺乳動物中有大量和多樣的冠狀病毒尚未被發現。

管軼的研究，填上了新冠病毒來源拼圖中的最關鍵一片。

隱秘傳播

除了跨種傳播，另一種具有最大可能性的傳播是SARS-CoV-2在完成跨種后可能在人與人之間形成了隱秘傳播（Cryptic Transmission）。從Bedford的序列分析中可見端倪。這一理論可能可以解釋為何武漢流行的主要為“L型” 。

但病毒突變形成Furin蛋白酶切割位點是病毒在動物中間宿主中形成，還是在人中隱秘傳播中突變形成，目前沒有明確答案。這同樣也提示應該持續監測病毒突變，尤其在現在大范圍傳播的情況下，應該持續關注引起表現型變化的病毒突變。

而回溯追蹤2019年12月之前醫院患者的樣本或許可以獲得隱秘傳播的信息。

但是COVID-19疫情提示動物病毒跨種傳播危害之大、可傳播范圍之廣，因此在疫情之后應出臺相應政策措施杜絕野生動物的販售。

祝愿朋友們和家人都平平安安。

關于我們：

Hanson解讀由在美國工作的醫生和醫學科學家組成，通過對經典研究論文的解讀和專家直接撰寫的述評，傳遞醫學進展信息；在探索及激發新的研究方向的同時，解析科研設計及論文撰寫規范。

成員主要包括：王宇歌博士，一直從事病毒新藥研發；金沖飛醫生，美國執業醫師；朱永紅博士，從事病毒研究，目前主要做新藥研發；謝琰臣博士，一直從事免疫病臨床科研和新藥研發。另外，特別感謝美國執業醫師Gloria醫生的友情支持和我們的編輯部。

聲明：

本公眾號推文僅為學術交流，不構成對臨床診治的意見。

編輯：Henry；