10月3日，國際頂級學(xué)術(shù)期刊Cell在線發(fā)表了中國科學(xué)院上海藥物研究所周虎課題組與復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院樊嘉院士課題組和中國科學(xué)院生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所高大明課題組合作的最新成果“Integrated Proteogenomic Characterization of HBV-related Hepatocellular Carcinoma”。

根據(jù)中科院上海藥物研究所官網(wǎng)介紹，該研究對159例感染慢性乙肝病毒（hepatitis B virus，HBV）的肝細(xì)胞癌（hepatocellular carcinoma，HCC）病人的癌組織和配對癌旁肝組織樣本進(jìn)行了蛋白基因組（proteogenomics）研究，完整地揭示了肝癌的分子特性，全面解析了肝癌的發(fā)生和發(fā)展機(jī)制，為肝癌的精準(zhǔn)分型與個(gè)體化治療、療效監(jiān)測和預(yù)后判斷提供了新的思路和策略。

論文提到，肝癌是全球第四大癌癥殺手，其中肝細(xì)胞癌約占原發(fā)性肝臟惡性腫瘤的85%-90%，最主要的病因是乙肝病毒(HBV)和丙肝病毒(HCV)的慢性感染，以及酗酒和代謝綜合征。

目前，直接抗病毒治療在治愈慢性HCV感染方面取得了成功，但在HBV方面，目前的抗病毒治療只能減少而不能消除。數(shù)據(jù)顯示，估計(jì)全球有2.92億人感染HBV。

值得注意的是，HBV感染是導(dǎo)致中國肝癌發(fā)生的最主要原因，其中約85%的肝癌患者攜帶HBV感染標(biāo)志。

研究團(tuán)隊(duì)提到，肝癌的發(fā)生發(fā)展是一個(gè)非常復(fù)雜的生物學(xué)過程，受到機(jī)體的系統(tǒng)性調(diào)控，基因突變會(huì)對HBV相關(guān)肝癌的表型產(chǎn)生怎樣的影響，目前這方面的研究報(bào)道較少，亟待深入探究。

同時(shí)，新藥研究需要進(jìn)行“源頭創(chuàng)新”，對肝癌的精準(zhǔn)分子分型及分型相關(guān)的潛在生物標(biāo)志物和藥物靶標(biāo)進(jìn)行研究，將有助于肝癌的個(gè)性化藥物研發(fā)。

肝癌的蛋白基因組研究

在這項(xiàng)最新的研究中，研究團(tuán)隊(duì)首先揭示了中國肝癌突變譜與西方肝癌突變譜的不同之處。

在肝癌領(lǐng)域長期引發(fā)廣泛關(guān)注及爭議的馬兜鈴酸，被世界衛(wèi)生組織（WHO）于2012年列為I類致癌物。這項(xiàng)最新研究發(fā)現(xiàn)，35%的研究病人樣本中含有馬兜鈴酸誘導(dǎo)的基因突變“指紋”，且突變“指紋”與腫瘤突變負(fù)荷增高、微環(huán)境免疫耐受顯著相關(guān)。這提示了免疫治療對該類肝癌的潛在價(jià)值，說明了基于中國人肝癌數(shù)據(jù)開展臨床轉(zhuǎn)化研究的必要性。

研究通過深入分析染色體拷貝數(shù)變異，揭示染色體4q和16q的缺失會(huì)通過反式效應(yīng)（trans effect）影響細(xì)胞周期相關(guān)蛋白并促進(jìn)肝癌的發(fā)生發(fā)展。

其次，論文提到，根據(jù)蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)可以將肝癌患者分為三個(gè)亞型，分別為代謝驅(qū)動(dòng)型、微環(huán)境失調(diào)型和增殖驅(qū)動(dòng)型，這三個(gè)亞型與基因組穩(wěn)定性、癌栓的有無、甲胎蛋白豐度及RB1和TSC2基因突變等特征顯著相關(guān)。

更重要的是，三個(gè)亞型的臨床預(yù)后顯著不同，且其預(yù)后價(jià)值不依賴于臨床上常用的TNM分期，有望為肝癌的個(gè)性化精準(zhǔn)治療和臨床預(yù)后判斷提供指導(dǎo)。

最后，該研究還系統(tǒng)地揭示了代謝異常在肝癌發(fā)生發(fā)展中的重要作用。研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)，80.3%的肝臟特異性的蛋白質(zhì)在腫瘤中表達(dá)下調(diào)，而膽固醇代謝的關(guān)鍵酶和谷氨酰胺代謝相關(guān)蛋白在腫瘤中表達(dá)上調(diào)。這些數(shù)據(jù)揭示，在感染HBV的HCC腫瘤中，肝臟特異性的功能發(fā)生代謝重編程。

該研究還從多組學(xué)層次系統(tǒng)性闡釋了各種細(xì)胞代謝和信號通路在肝癌中的變化趨勢，其中糖酵解和脂肪酸代謝在癌中整體上調(diào)，膽汁酸代謝整體下調(diào)。

此外，作為肝癌最常見的突變基因之一，CTNNB1突變型和野生型肝癌之間的蛋白質(zhì)和磷酸化差異主要聚集于代謝通路。分析發(fā)現(xiàn)，果糖二磷酸醛縮酶A（ALDOA）的磷酸化與CTNNB1突變相關(guān)。機(jī)制研究表明，ALDOA磷酸化可以增強(qiáng)肝癌細(xì)胞的糖代謝，進(jìn)而促進(jìn)肝癌的生長成瘤，且ALDOA的活性對于CTNNB1突變的肝癌細(xì)胞的增殖非常重要。

研究團(tuán)隊(duì)認(rèn)為，靶向調(diào)控代謝通路在肝癌防治中或?qū)l(fā)揮重要的作用。

團(tuán)隊(duì)提到，該研究是國際首次按照最高標(biāo)準(zhǔn)對乙肝相關(guān)肝癌的大隊(duì)列臨床樣本進(jìn)行的全景式多層次分析，不僅有新的有生物學(xué)意義的發(fā)現(xiàn)，而且產(chǎn)生的高質(zhì)量大數(shù)據(jù)將為廣大肝癌基礎(chǔ)與臨床研究者提供支持，從而有力推動(dòng)肝癌研究領(lǐng)域的發(fā)展。