控制瘧疾有效手段是快速診斷和抗瘧治療，以減少疾病和死亡。自2001年以來，以青蒿素為基礎的聯合療法（ACT）在瘧疾治療中發揮至關重要作用，因為青蒿素與其他藥物相結合能快速減少寄生蟲以確保完全治愈。然而，寄生蟲的耐藥性威脅著瘧疾控制。

與Pfkelch13突變相關的青蒿素部分耐藥性最近在幾個非洲國家出現，導致寄生蟲清除時間變慢。在聯合使用的藥物仍然有效的情況下，青蒿素部分耐藥性不會導致ACT失敗，但如果聯合使用藥物也產生耐藥，將危及ACT的治療效果。為應對這一威脅，世衛組織于2022年啟動了一項應對非洲耐藥性的戰略。該戰略旨在通過循證措施改善檢測、及時應對和減少耐藥性影響。

該策略包括多項措施，包括旨在延長以青蒿素為基礎的聯合療法治療時長的多項一線治療措施。該實施指南通過定義MFT、審查其對耐藥性的影響、評估對政策和實施的影響以及確定未來研究的證據缺口，為瘧疾規劃提供指導。