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季節(jié)性流感如何傳播?有何規(guī)律?復(fù)旦團(tuán)隊在Science發(fā)文
研究季節(jié)性流感的全球傳播模式,對于制定流感防控措施具有重要科學(xué)意義。2024年11月8日,復(fù)旦大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院余宏杰教授團(tuán)隊關(guān)于季節(jié)性流感的全球時空傳播動態(tài)及驅(qū)動機(jī)制的最新研究成果,以“COVID-19 pandemic interventions reshaped the global dispersal of seasonal influenza viruses”為題,在《科學(xué)》(Science)雜志上發(fā)表。

《科學(xué)》(Science)網(wǎng)站,余宏杰團(tuán)隊發(fā)文。本文圖片均為 復(fù)旦大學(xué)上海醫(yī)學(xué)院供圖
過去一百年里,全球暴發(fā)過多次流感大流行,分別是1918年西班牙H1N1流感、1957年亞洲H2N2流感和1968年香港H3N2流感,以及2009年甲型H1N1流感。
盡管國際科學(xué)界在流感的流行病學(xué)領(lǐng)域已開展多年深入研究,但遺憾的是,還無法突破關(guān)鍵理論和技術(shù)以闡釋兩大問題:精確解析流感疫情在全球每年周而復(fù)始的發(fā)生規(guī)律、時空擴(kuò)散過程及其驅(qū)動機(jī)制。

復(fù)旦大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院余宏杰教授團(tuán)隊。
面對國際科學(xué)難題,余宏杰團(tuán)隊首先從疾病自然史出發(fā),突破對疫情發(fā)生規(guī)律的已有認(rèn)知,解析個體和群體的疾病負(fù)擔(dān),最后確定其特異的傳播網(wǎng)絡(luò)和演化機(jī)制。通過前期的深入研究和積累,余宏杰察覺到,COVID-19大流行給所有呼吸道傳染病研究帶來了“機(jī)會”:盡管感染不同呼吸道傳染病病原體誘導(dǎo)的特異性免疫不同,但COVID-19大流行期間所采取的非藥物性干預(yù)措施對其傳播的阻斷作用是共通的。
余宏杰重點(diǎn)思考這些問題:COVID-19大流行是否會影響季節(jié)性流感的全球傳播和進(jìn)化動態(tài)?可否重塑季節(jié)性流感全球傳播和進(jìn)化的格局?季節(jié)性流感何時恢復(fù)至大流行前的水平?余宏杰帶領(lǐng)團(tuán)隊抽絲剝繭、層層深入開展研究。余宏杰的博士研究生陳志元從描述大流行期間全球季節(jié)性流感病毒的活動強(qiáng)度入手,不出意外地發(fā)現(xiàn)其整體活動水平顯著降低,并且B/Yamagata譜系自2020年3月后似乎“銷聲匿跡”,但伴隨全球針對COVID-19非藥物性干預(yù)措施的逐步解除,流感病毒的活動水平又逐漸開始恢復(fù)。
COVID-19大流行期間施加的非藥物干預(yù)措施打破了季節(jié)性流感傳播的“常態(tài)”,目前,國際科學(xué)界尚未揭示其從“擾亂”到“恢復(fù)”的全過程。2023年6月至8月,余宏杰領(lǐng)銜的國際合作團(tuán)隊重建了COVID-19大流行前、中、后全球季節(jié)性流感的傳播模式。
研究聚焦在重建四個時期“大流行前期(2017年1月-2020年3月)、大流行期的急性階段(2020年4月-2021年3月)、大流行期的轉(zhuǎn)變階段(2021年4月-2023年4月)和大流行后期(2023年5月-2024年3月)”的全球季節(jié)性流感傳播動態(tài)。余宏杰表示,團(tuán)隊整合全球流感流行病學(xué)監(jiān)測數(shù)據(jù)、基因序列數(shù)據(jù)和人群航空流量數(shù)據(jù),將全球分成了12個區(qū)域,在貝葉斯系統(tǒng)動力學(xué)的框架下重構(gòu)了四個時期的季節(jié)性流感傳播模式,并估計了傳播的相關(guān)參數(shù)和潛在驅(qū)動因素。

全球航空流量變化及在流感傳播中的作用
研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),季節(jié)性流感的活動水平和區(qū)域間航空流量均經(jīng)歷了“下降后恢復(fù)”的過程。區(qū)域間航空流量往往代表著長距離的人群移動情況。在時間異質(zhì)性的系統(tǒng)動力學(xué)模型框架下進(jìn)一步結(jié)合基因序列數(shù)據(jù),團(tuán)隊發(fā)現(xiàn),區(qū)域間航空流量是四個時期全球季節(jié)性流感傳播的主要驅(qū)動因素。通過估計地理進(jìn)化樹中的主干區(qū)域,發(fā)現(xiàn)大流行期間,南亞和西亞分別是維持A型流感和B/Victoria循環(huán)的關(guān)鍵區(qū)域。
為評估大流行期間不同流感季的傳播強(qiáng)度和傳播模式相似性,團(tuán)隊又進(jìn)一步運(yùn)用多維尺度分析方法研究了季節(jié)性流感傳播的恢復(fù)。研究發(fā)現(xiàn),大流行后期(2023年5月-2024年3月),全球季節(jié)性流感傳播的模式和強(qiáng)度已基本恢復(fù)至大流行前的水平。

全球季節(jié)性流感的傳播動態(tài)
本研究識別了全球季節(jié)性流感的流行特征和傳播關(guān)鍵區(qū)域,明確了針對COVID-19的非藥物性干預(yù)措施對區(qū)域流感病毒進(jìn)化/循環(huán)獨(dú)立性的影響,以及大流行后流感傳播模式的穩(wěn)健恢復(fù)以及新型流感毒株起源地的不確定性,強(qiáng)調(diào)了加強(qiáng)呼吸道病原體的病毒學(xué)和基因監(jiān)測、及時調(diào)整疫苗接種策略和監(jiān)測方向的重要性。研究結(jié)果對未來大流行的綜合應(yīng)對提供了實(shí)證依據(jù),將加深大流行情境下對季節(jié)性呼吸道病原體傳播和進(jìn)化的理解。
《科學(xué)》(Science)雜志編輯及審稿人對論文高度評價:“研究結(jié)構(gòu)和內(nèi)容豐富”、“COVID-19大流行為流感傳播提供的研究視角是獨(dú)一無二的”、“研究提供了對季節(jié)性流感譜系動力學(xué)的最新理解,也定量剖析了大流行期間人群移動模式的變化在全球季節(jié)性流感傳播的作用”。
復(fù)旦大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院2022級博士生陳志元是此文章的獨(dú)立第一作者。復(fù)旦大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院教授、上海市重大傳染病和生物安全研究院與復(fù)旦大學(xué)附屬華山醫(yī)院感染病科雙聘PI余宏杰與牛津大學(xué)Moritz Kraemer教授、比利時魯汶大學(xué)Philippe Lemey教授、皇家獸醫(yī)學(xué)院Oliver Pybus教授為共同通訊作者。





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