隨著臺風預警的解除和風力的減弱，洋山口岸各碼頭逐步具備了生產作業條件，小洋山島和上海南港碼頭的值守民警開始清理查驗現場的積水，移除防汛抗臺設施，檢查各查驗設施運行情況，為港口恢復運營做準備。

9月16日20時30分，洋山港迎來恢復運營后的首艘靠港外輪。上海洋山邊檢供圖

據洋山邊檢站統計，受本次臺風“貝碧嘉”影響，累計有52艘次國際航次船舶受變更靠離泊計劃，9月16日17時起至23時30分，計劃有13艘船舶密集進港，目前已收到11艘船舶的靠港計劃。

15時，東海大橋開始清理路面，20時東海大橋恢復車輛雙向通行，21時30分洋山港恢復進提箱作業。20時30分，中國香港籍“中海火星”輪等五艘船舶開始陸續進港，靠泊洋山一、三、四期碼頭。

臺風過境后船舶進港有著“短時間、大密度”的特點，為迎戰船舶進港高峰期，洋山邊檢站加強與港區、代理和船方聯系并結合船舶自動識別系統，準確掌握船舶進港時間。同時，對進港船舶進行梳理，區分入境、入港和回靠港口作業等情形，將現場值守警力進行分組，采取窗口查驗和移動查驗車相結合的模式，提高查驗效率，保障口岸快速恢復正常運營。