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科學家首次發現量子力學如何導致基因突變

澎湃新聞記者 王蕙蓉
2022-05-11 21:44
來源:澎湃新聞
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近日,科學家表示量子力學可以解釋基因突變的原因,并首次通過計算機建模,探究出量子力學如何導致基因突變。

圖片來自Getty Images/iStockphoto

脫氧核糖核酸(DNA)攜帶有合成核糖核酸(RNA)和蛋白質所必需的遺傳信息,是生物體發育和正常運作必要的生物大分子。DNA能夠以極高精度進行大量復制,但這一過程也可能出現錯誤,并導致基因突變。這一突變在給人類帶來多種疾病的同時,也促進了豐富的生物世界。

19世紀50年代,詹姆斯·沃森和弗朗西斯·克里克發現了DNA雙螺旋結構,開啟了分子生物學時代,將遺傳研究深入到分子層次,“生命之謎”隨之被解開,人們開始清楚了解遺傳信息的構成與傳遞途徑。

DNA雙螺旋結構由兩條鏈組成,這兩條鏈按反向平行方式盤旋成雙螺旋結構,如同螺旋式上升的樓梯,而這些樓梯的“臺階”正是氫鍵。DNA分子的兩條鏈之間通過氫鍵結合,即通過一種稱為質子(氫原子的原子核)的亞原子粒子所提供的粘合劑,將被稱為堿基的分子連接在一起,以保持雙螺旋結構的穩定。

DNA雙螺旋結構與形成該結構的4種堿基

形成穩定螺旋結構的堿基對中有4種不同堿基,分別為:腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、鳥嘌呤(G)、胞嘧啶(C)。雙螺旋模型不僅表明了DNA分子結構,還提示了DNA復制的機制:由于腺嘌呤(A)總是與胸腺嘧啶(T)配對、鳥嘌呤(G)總是與胞嘧啶(C)配對,這說明兩條鏈的堿基順序是彼此互補的,只需確定其中一條鏈的堿基順序,就可確定另一條鏈的堿基順序。

通常情況下,堿基遵循著嚴格的配對規則(A與T、C與G配對),但如果氫鍵的性質略有變化,就可能導致前述配對規則被打破。如果該過程發生在雙鏈斷開前,就會導致堿基配對錯誤,引發基因突變。雖然克里克和沃森此前做出過預測,但直到今天,通過復雜的計算建模,科學家才得以準確地量化這一過程。

此次,來自英國薩里大學勒沃休姆量子生物學博士培訓中心(QB-DTC)的物理學家與化學家借助復雜的計算建模,表明前述基因突變(即DNA復制錯誤)可能是由于量子力學導致的。團隊使用了一種開放量子系統(open quantum systems)方法,來確定可能導致質子在DNA雙鏈之間跳躍的物理機制:基于量子物理學中的隧穿效應,質子才得以跳躍。相關成果發表在《自然》旗下期刊《通訊-物理》(Communications Physics)。

圖片來自《通訊-物理》(Communications Physics)

據了解,量子隧穿效應是指在某些特定條件下,微觀粒子“穿越”原本無法逾越的勢壘阻礙的現象。要理解隧穿,可以把勢壘想象成一座山。一個自身能量小于山峰勢能的微觀粒子位于山的左側,按照經典世界的常規經驗,這個粒子絕對爬不到山的右側。但過段時間再去觀察粒子,可能會發現它“穿山而過”抵達了右側,這種現象就是量子隧穿效應。隧穿效應也是現代電子學技術的基礎之一,比如掃描隧道顯微鏡就是根據隧穿效應原理所制成。

薩里研究小組表明,DNA雙鏈之間氫鍵的變化比此前認為的要普遍得多,其發生概率約為萬分之1.73。也就是說,質子可以相對輕易地跳躍到到雙鏈的另一側,即從能量壁壘一側的位置躍遷到另一側。如果這恰好發生在DNA復制過程的第一步,即兩條鏈被斷開之前,那么錯誤就會通過細胞內的復制機制,導致DNA錯配,即一條鏈上的堿基與另一條鏈上相應的堿基不互補,甚至發生突變。

互變異構體(Tautomeric)發生概率,圖片來自論文

以往科學家認為,量子隧穿效應不太可能發生在活體生物細胞內溫暖、潮濕和復雜的環境中。然而,奧地利物理學家歐文·薛定諤在1944年的著作《生命是什么?》(What Is Life?)中提到,由于活體生物的表現與無生命物質不一樣,量子力學可以在生命系統中發揮作用。這項研究似乎證實了薛定諤的理論。

前述團隊確定,局部的細胞環境導致行為類似于波的質子被熱激活,并穿過能量壁壘。他們發現質子是連續并且非常迅速地在兩條鏈之間隧穿。之后,當DNA分裂成單獨的鏈時,一些質子被捕獲在錯誤的一側。

鳥嘌呤-胞嘧啶堿基對之間質子轉移反應示意圖,圖片來自論文

“DNA中的質子可以沿著DNA中的氫鍵隧穿,并修改編碼遺傳信息的堿基。這些修改過的堿基被稱為‘互變異構體’,可以在DNA裂解和復制過程中存活,導致‘轉錄錯誤’或突變。”英國薩里大學Louie Slocombe在博士學位期間進行了前述計算,并由薩里大學物理系教授Jim Al-Khalili和化學系博士Marco Sacchi指導。

Al-Khalil對此評價:“沃森和克里克在50多年前就推測了DNA中量子力學效應的存在以及重要性,然而這種量子力學效應在很大程度上被忽視了。”

“生物學家通常認為,只有在低溫和相對簡單的系統中,隧穿效應才能發揮重要作用。因此,他們傾向于低估DNA中的量子效應。通過我們的研究,我們相信已經證明了這些假設并不成立。”Sacchi博士說道。

前述研究成果表明了量子隧穿在基因突變中的重要性,以及質子的轉移在DNA突變中具有更加重要的作用,未來可能對目前的基因突變模型產生深遠影響。

    責任編輯:李躍群
    校對:張艷
    澎湃新聞報料:021-962866
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