1918年，在第一次世界大戰(zhàn)的末尾，由甲型 H1N1 流感病毒引發(fā)的“西班牙流感”大流行（下稱“1918年大流行”），橫掃美洲、歐洲、亞洲，甚至愛斯基摩人聚集區(qū)。在此次COVID-19之前，1918年大流行可謂是人類歷史上最嚴(yán)重的流行病疫情，造成全球5000萬至1億人死亡，這數(shù)據(jù)可能還存在嚴(yán)重低估。

盡管1918年有初步報告已經(jīng)猜測，流感大流行是由病毒引起，但直到20世紀(jì)30年代這一猜測才被證實，當(dāng)時有證據(jù)表明疾病與流感病毒有關(guān)。20世紀(jì)90年代末，科學(xué)家對1918年大流行時用福爾馬林固定、石蠟包埋的組織樣本和永凍保存的尸體進(jìn)行研究，最終確定病原體是H1N1亞型的甲型流感病毒(IAV)。 

圍繞著這場世紀(jì)大災(zāi)難仍然有許多未解決或仍在爭論中的問題。德國羅伯特·科赫研究所等團(tuán)隊的研究人員認(rèn)為，和分子分析工具推動了該領(lǐng)域的研究類似，從歷史檔案樣本中提取核酸的最新進(jìn)展也可以幫助他們?nèi)ヌ剿鱽碜詺W洲的病理學(xué)樣本。此前的樣本幾乎來自北美地區(qū)。

北京時間5月10日晚間，國際學(xué)術(shù)期刊《自然-通訊》（Nature Communication）在線發(fā)表了羅伯特·科赫研究所Se?bastien Calvignac-Spencer等人的一項最新研究，題為“歐洲流感病毒基因組檔案揭示了1918年流感大流行期間的基因組變異”（ Archival influenza virus genomes from Europe reveal genomic variability during the 1918 pandemic）。Spencer是病毒進(jìn)化和高致病性微生物的流行病學(xué)方面的專家。

研究團(tuán)隊分析了德國和奧地利博物館歷史檔案中收藏的13個肺部樣本，這些樣本來自不同的個體，采集時間為1900年至1931年，其中6個樣本采集自歐洲大流行期間，即1918年（4個）和1919年（2個）。

對其中的3份流感陽性樣本，即MU-162(慕尼黑)、BE-572（柏林）和BE-576(柏林)進(jìn)行測序，最后重建了MU-162的完整基因組和BE-572、BE-576的部分基因組（分別為89.3%和57.2%）。

結(jié)合此前科學(xué)家重建的兩個完整的IAV基因組，分別從1918年9月死于紐約厄普頓營(CU)和1918年11月死于阿拉斯布雷維格(BM)的病例身上獲得，研究團(tuán)隊通過比較表明，存在可測量的基因組可變性，在相同大陸(0.11-0.16%)和在大流行同期(0.11%)采樣的基因組比在不同大陸(0.16-0.32%)和不同時期(0.16-0.21%)采樣的基因組總體差異更低。這些基因組多樣性與本土傳播和長距離擴(kuò)散相結(jié)合的事件也是一致的。

對大流行高峰之前和期間的基因組進(jìn)行比較還顯示，1918年IAV與宿主抗病毒反應(yīng)和耐藥性相關(guān)的核蛋白基因的兩個位點發(fā)生了變異。研究團(tuán)隊認(rèn)為，這些突變可能代表了早期適應(yīng)人類的特征：在其傳播的最初幾個月，1918年流感病毒可能進(jìn)化出更好的躲避先天干擾素反應(yīng)的能力，這是流感病毒致病性的一個重要方面。

研究團(tuán)隊還進(jìn)行了分子鐘建模，這種方法能用來估算演化的時間尺度。他們發(fā)現(xiàn)，季節(jié)性H1N1流感病毒的所有基因組片段可能都是1918年大流感初始毒株的直接后代。這駁斥了認(rèn)為該季節(jié)性病毒來自基因重組（不同病毒的基因組片段發(fā)生互換）的其他假說。研究同時強調(diào)，鑒于建模方法的局限，目前證據(jù)還不能讓他們完全肯定地支持該結(jié)論。

論文最后還強調(diào)了他們的樣本量依然極為有限，基本來自3個完整基因組和2個部分基因組，因此這項研究的所有發(fā)現(xiàn)仍然是初步的。

但研究團(tuán)隊強調(diào)，這項研究讓我們進(jìn)一步認(rèn)識了1918年流感大流行的演變和發(fā)展。同時，團(tuán)隊預(yù)計，更好地了解1918年大流感病毒進(jìn)化的主要障礙將在于對保存下來的病理標(biāo)本的鑒定，這同樣也體現(xiàn)出歷史檔案保存和使用的重要性。