4月18日，一則關于“京醫通即將停運”的文件在網上流傳。該文件落款章為北京怡合春天科技有限公司，內文稱，該公司為京醫通線上系統的建設和運營方，北京銀行股份有限公司為京醫通線上系統出資方，拒絕履行出資義務，該公司獨自負擔京醫通項目數億元成本長達七年，因無力承擔高昂的運營成本，京醫通線上系統將于2022年4月20日9時起正式停運。

北京市衛健委19日回應，北京怡合春天科技有限公司作為京醫通線上系統的運營方，與出資建設方北京銀行股份有限公司產生糾紛。北京市衛生健康委員會和北京市醫院管理中心前期已關注到此事，并指導當事方積極解決糾紛。4月18日晚，網上流出北京怡合春天科技有限公司停運通知。北京市衛生健康委員會和北京市醫院管理中心已緊急通知雙方，將進一步督促指導雙方從維護公眾利益出發，依法理性解決糾紛，使廣大群眾能夠繼續獲得便利的線上預約服務。

4月19日，北京銀行方面表示：“我行已收到北京怡合春天科技有限公司關于‘京醫通’停運的通知。一直以來我行高度重視‘京醫通’的安全運行工作，我行將切實履行社會責任，繼續與北京怡合春天科技有限公司進行積極的溝通，以理性的態度，加強各方協同，確保患者正常就醫。”