6月14日，澎湃新聞獲悉，科技部舉行新聞通氣會，就施普林格出版集團旗下期刊《腫瘤生物學》撤回107篇中國醫學論文一事首次作出回應，表示正在對撤稿論文逐一徹查，對查實存在問題的論文作者將按照統一尺度、甄別責任、嚴肅處理，向社會公開，形成“零容忍”的態勢，堅決遏制學術不端行為滋生蔓延的勢頭。

4月20日，《腫瘤生物學》宣布一次性撤回107篇來自中國的醫學論文，發表時間為2012年至2016年。撤稿原因是論文涉及偽造虛假同行評審。

為了處理這一學術造假事件，科技部部長萬鋼在6月5日召集科研誠信建設聯席第六次會議，部署處理工作。科技部牽頭會同中國科協、教育部、衛生計生委、自然科學基金等部門成立聯合工作組，制定了徹查處理工作方案。各部門對論文質量、論文署名情況、撰寫發表過程、代寫代投第三方機構情況、論文使用情況等開展徹查，基本查清了撤稿論文的情況。

同時，各部門對涉事論文作者承擔或正在申請科研項目（基金）、基地建設、人才計劃和科技獎勵等情況進行了全面排查，對相關科研項目、基金等予以暫停。

針對此次撤稿事件中參與造假的第三方中介結構，各部門聯合啟動網下清掃工作，打擊論文造假的“灰色產業鏈”。

“有一定證據表明，提供所謂語言編輯服務的第三方機構（注：一些提供論文代投服務的機構）在操縱評審流程上發揮了作用。” 施普林格細胞生物學及生物化學編輯總監彼得·巴特勒（Peter Butler）參與了期刊撤稿前的調查，他曾對澎湃新聞（www.kxwhcb.com）如是表示。

科技部表示：此次論文集中撤稿事件雖是個別案例，但影響十分惡劣，嚴重損害了我國科技界的國際聲譽和廣大科技人員的尊嚴，同時也反映出我國學術環境和對學術不端行為的懲戒體系和力度都還需要進一步改進。

科技部政策法規與監督司司長賀德方表示，“撤稿”是學術期刊自我凈化、自我糾錯的機制。正常的撤稿應當是期刊針對已發表的論文，發現問題的，隨時發現，隨時撤稿。但對數年來的論文集中、大規模撤稿則是不正常的，一定程度上也是不負責任的。

“長期以來，我國廣大科技人員堅守高尚的精神境界和良好的道德操守，潛心研究、勇于探索、淡泊名利、求真務實，取得了舉世矚目的成就，涌現了一大批像黃大年、李保國這樣具有愛國之情、報國之志的優秀科學家。絕不能因為個別科研人員違反科研誠信要求、違背科學精神，就否定我們整個科技人員隊伍，否定廣大科研人員做出的杰出貢獻。”賀德方表示。