建檔立卡貧困村的人居衛生條件十分落后，糞便暴露、人畜混居、飲水不潔、垃圾亂扔等問題非常嚴重，是貧困村村民致病致貧的重要原因之一。為此住建部、全國愛衛辦、環保部、農業部、水利部、國務院扶貧辦和中國農發行聯合發布意見，決定到2020年年底讓所有貧困村達到人居衛生條件標準。

意見提出，屆時居民飲用水基本安全，戶戶實現人畜分居，衛生廁所普及率明顯提高，人畜糞便暴露現象基本消除，農村生活垃圾得到全面治理，農戶住房具有基本的通風、采光和保溫功能并保障安全。

為此各地要消除人畜糞便暴露，加快推進衛生廁所改造。推進人畜分居，避免居住與養殖同室混雜。治理農村垃圾，推行垃圾就地分類減量，逐步取締敞開式收集、轉運設施，2017年年底前全面完成陳年垃圾清理工作。