據日本媒體報道，東京奧運會和殘奧會結束后，東京奧組委的員工將在10月份從最多時的7000人減少到大約1100人，整個奧組委預計在明年6月解散。

2021年9月5日，日本東京，2020東京奧運會、殘奧會正式落幕，工人拆除宣傳標識。人民視覺 圖

據《日經新聞》透露，盡管東京奧運會和殘奧會總體上虧損已成定局，但具體虧損的金額是多少，還需要明年4月才能確定。東京奧組委首席執行官武藤敏郎在殘奧會結束后也表示，現在無法推算虧損的規模。

由于禁止觀眾入場觀看比賽，僅僅門票一項，東京奧組委的損失就可能達到8億美元，約占奧組委原計劃總收入的10%。另外，防疫措施也都增加了大量的人力物力，這也讓預算大大增加。

東京奧運會延期一年使總預算由最初的1.35萬億日元（約合130億美元）增加到1.644萬億日元（約合158.2億美元）。