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免疫缺陷新冠患者病毒追蹤:感染逾百天,病毒在體內發生演化
在超長期持續感染新冠病毒(SARS-CoV-2)的過程中,病毒在患者體內會發生什么變化?
當地時間2月5日,國際頂級學術期刊《自然》(Nature)以“加快評審文章”(Accelerated Article Preview)形式在線發表了由英國劍橋大學、倫敦大學學院、牛津大學等團隊的一項新冠病毒感染病例的研究,他們發現:一名免疫抑制患者在接受恢復期血漿治療的同時出現了新冠病毒的不同變異株,接受血漿治療后,占主導的SARS-CoV-2變異株含有英國發現的變異株B.1.1.7上的一個缺失突變。

研究記錄了在免疫缺陷宿主的持續感染過程中,SARS-CoV-2在抗體治療中的重復演化反應。結果提示了一種可能性,即當免疫抑制患者出現長期病毒復制時,他們體內的SARS-CoV-2可能會發生演化。
該研究的通訊作者為英國劍橋大學病毒學及臨床微生物學教授、劍橋治療免疫學和傳染病學研究所核心研究人員Ravindra Gupta。
Gupta及其同事描述了一個病例研究,研究對象是一名感染了SARS-CoV-2的七十多歲的免疫抑制男性患者,曾接受過淋巴瘤化療。這名患者于2020年夏季入院,在101天里接受過抗生素、類固醇、幾個療程的瑞德西韋和恢復期血漿治療,但都不見效。
研究團隊在23個不同的治療時間點采集了病毒樣本。造成感染的SARS-CoV-2變異株屬于譜系20B(在刺突蛋白上攜帶了會造成D614G替換的突變)。
在患者前57天服用兩個療程的瑞德西韋后,研究觀察到總體病毒群體結構變化不大。然而,在恢復期血漿治療后,研究觀察到大量動態的病毒種群變化。
他們發現一個變異株比例開始增加,這個變異株的刺突蛋白(S蛋白,病毒感染宿主的“鑰匙”)上出現了兩個突變:一個是位點69/70的缺失突變(出現在英國變異株B.1.1.7中),還有一個會造成D796H替換的突變。這個種群在第三輪瑞德西韋(第93天)和恢復期血漿(第95天)治療后又重新出現。
體外實驗顯示,帶有69/70和D796H的S蛋白逃逸雙突變體對恢復期血漿的敏感性略有降低,但感染性與野生型相似。研究提到,D796H似乎是降低易感性的主要原因,69/70單突變體的感染性則是野生型的2倍,這可能也彌補了D796H的感染性降低。
研究認為,這些數據顯示,在出現病毒變異的恢復期血漿治療期間,SARS-CoV-2受到了強烈的選擇。有證據表明,病毒對中和抗體的敏感性降低,這些病毒對含有多克隆抗體的恢復期血漿的敏感性降低了一半。
但他們總結表示,這個變異株的出現不是治療失敗的主要原因。
研究同時強調,這只是單個病例研究,因此只能對結果進行有限的外推。但是,研究結果或能提醒人們警惕使用恢復期血漿治療免疫抑制患者的SARS-CoV-2感染。
值得注意的是,變異毒株B.1.1.7以及古普塔等人的研究,也給世界提出了一個醒:需要關注免疫系統脆弱人群在新冠大流中的潛在作用。如果他們為病毒提供了進化譜系的機會,而新產生的譜系傳播速度更快,更具致病性或沒有疫苗,那么這些慢性感染不僅對患者構成危險,而且還可能改變新冠大流行的進程。





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